Ethyl mercaptan, là một hợp chất hữu cơ dễ bay hơi, đòi hỏi phải tuân thủ nghiêm ngặt các điều kiện và quy định cụ thể trong quá trình bảo quản. Đầu tiên, môi trường bảo quản phải mát mẻ, khô ráo và{1}thông gió tốt, với nhiệt độ lý tưởng được duy trì dưới 0 độ để giảm nguy cơ bay hơi và oxy hóa. Đồng thời, do tính chất nhạy cảm với ánh sáng nên ethyl mercaptan cần được bảo quản ở nơi tối. Chai thủy tinh, hộp đựng bằng thép không gỉ và lon nhôm là những hộp đựng lý tưởng vì chúng giúp kéo dài thời hạn sử dụng của ethyl mercaptan một cách hiệu quả và duy trì tính ổn định hóa học của nó. Ngoài ra, phải chú ý tránh trộn lẫn ethyl mercaptan với các hóa chất khác và để xa nguồn lửa để đảm bảo an toàn. Nhân viên xử lý ethyl mercaptan phải đeo thiết bị bảo hộ thích hợp như găng tay, kính bảo hộ và quần áo bảo hộ để tránh kích ứng và tổn thương da và mắt.